Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc83Q9D4V3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms