Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Efhd1Q9D4J1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Efhd1Q9D4J1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Efhd1Q9D4J1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Efhd1Q9D4J1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Efhd1Q9D4J1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Efhd1Q9D4J1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Efhd1Q9D4J1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Efhd1Q9D4J1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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Efhd1Q9D4J1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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Efhd1Q9D4J1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms