Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms