Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms