Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ss18l2Q9D174 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ss18l2Q9D174 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ss18l2Q9D174 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ss18l2Q9D174 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ss18l2Q9D174 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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