Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk1aQ9D132 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Upk1aQ9D132 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Upk1aQ9D132 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Upk1aQ9D132 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Upk1aQ9D132 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Upk1aQ9D132 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Upk1aQ9D132 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Upk1aQ9D132 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms