Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms