Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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