Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc1Q9CWW7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms