Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn1Q9CWM4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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