Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms