Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms