Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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