Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Nicn1Q9CQM0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Nicn1Q9CQM0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Nicn1Q9CQM0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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