Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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Rdm1Q9CQK3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Rdm1Q9CQK3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Rdm1Q9CQK3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Rdm1Q9CQK3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Rdm1Q9CQK3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Rdm1Q9CQK3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Rdm1Q9CQK3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Rdm1Q9CQK3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Rdm1Q9CQK3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Rdm1Q9CQK3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Rdm1Q9CQK3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Rdm1Q9CQK3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rdm1Q9CQK3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Rdm1Q9CQK3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Rdm1Q9CQK3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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