Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DenrQ9CQJ6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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