Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms