Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cox6cQ9CPQ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms