Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn6Q99PL6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms