Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrtQ99MR6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms