Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms