Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ciao1Q99KN2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms