Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf11Q99JX1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms