Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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