Protein–RNA interactions for Protein: Q925J9

Med1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med1Q925J9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med1Q925J9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med1Q925J9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Med1Q925J9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med1Q925J9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med1Q925J9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med1Q925J9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med1Q925J9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med1Q925J9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med1Q925J9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med1Q925J9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med1Q925J9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med1Q925J9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med1Q925J9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med1Q925J9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Med1Q925J9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Med1Q925J9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med1Q925J9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med1Q925J9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Med1Q925J9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Med1Q925J9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Med1Q925J9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms