Protein–RNA interactions for Protein: Q920B0

Frmd4b, FERM domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4bQ920B0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms