Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms