Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms