Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms