Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS0

Pglyrp2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp2Q8VCS0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Pglyrp2Q8VCS0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Pglyrp2Q8VCS0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Pglyrp2Q8VCS0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Pglyrp2Q8VCS0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Pglyrp2Q8VCS0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pglyrp2Q8VCS0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pglyrp2Q8VCS0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pglyrp2Q8VCS0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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