Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms