Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf1Q8R3P9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms