Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms