Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms