Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx8Q8CFD4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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