Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Lin52Q8CD94 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Lin52Q8CD94 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Lin52Q8CD94 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Lin52Q8CD94 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Lin52Q8CD94 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Lin52Q8CD94 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Lin52Q8CD94 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Lin52Q8CD94 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Lin52Q8CD94 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Lin52Q8CD94 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lin52Q8CD94 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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