Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms