Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd4aQ8CBY1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms