Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubqln3Q8C5U9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubqln3Q8C5U9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms