Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdsp2Q8BX07 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ctdsp2Q8BX07 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ctdsp2Q8BX07 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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