Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtpaQ8BWP5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms