Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Usp38Q8BW70 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Usp38Q8BW70 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Usp38Q8BW70 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
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Usp38Q8BW70 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Usp38Q8BW70 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Usp38Q8BW70 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Usp38Q8BW70 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Usp38Q8BW70 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Usp38Q8BW70 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Usp38Q8BW70 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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