Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcal1Q8BJL0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms