Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrrc27Q80YS5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms