Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul9Q80TT8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul9Q80TT8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms