Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NischQ80TM9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
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