Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42bpbQ7TT50 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms