Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms