Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms