Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms